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KMID : 0364820110470020103
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Korean Journal of Microbiology
2011 Volume.47 No. 2 p.103 ~ p.109
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Development of a Rapid Detection Method for Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Using the Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP)
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Kim Jeong-Gu
No Ji-na
Park Dong-suk
Yoon Byoung-su
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Abstract
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Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (PCC)는 세균성 무름병균으로 주로 감자, 양배추 등의 식물에서 질병을 일으킨다. 본 연구에서는 현장에서 신속하게 진단하기 위해 loop-mediated isothermal amplification법을 이용하여 1시간 내에 등온에서 검출 가능한 진단법을 개발하였으며, 이를 PCC-LAMP법이라 명명하였다. PCC의 lytic murein transglycolase 유전자를 특이적으로 증폭시키는 4개의 프라이머를 제작하였으며 최적 온도가 61°C임을 확인하고 최적 조건을 확립하였다. 최적 조건을 바탕으로 4개의 프라이머가 1×103 copies까지 검출하는 민감성을 확인할 수 있었다. 본 연구에서 개발된 PCC-LAMP법은 특이성 검사를 통해 PCC만이 특이적으로 검출됨을 확인하였으며, 이는 실제 시료에서도 적용 가능함을 확인하였다. PCC-LAMP법을 통하여 PCC를 신속하고 정확하게 검출함으로써 현장에서 유용하게 적용될 수 있을 것으로 사료된다.
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KEYWORD
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Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, cabbage, detection, LAMP, soft rot
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FullTexts / Linksout information
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Listed journal information
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